Krokodillen leggen eieren .het paaren doen ze in het water op verschilende tijdstippen van het jaar, afhankelijk van de soort en het leefgebied.
Ongeveer twee maanden na het paren gaat het vrouwtje op zoek naar een plek op het land waar ze een nest kan maken om haar eieren in te leggen. Sommige soorten graven een gat in het zand en leggen daarin hun eieren, bijvoorbeeld de Mississippi-alligator, een nestheuvel bouwd van modder en plantaardig materiaal. Het belangrijke is dat in het nest een vaste temperatuur is en dat is geen gemakkelijke opgave, want de dag- en nachttemperatuur van de omgeving kunnen enorm varixebren.
Het vrouwtje legt 20 tot 80 eieren, ongeveer xe9xe9n per halve minuut. Ze zorgt goed voor haar kinderen, iets dat bij de meeste reptielen niet doen. Wanneer ze de eieren bedekt heeft, bewaakt ze haar eieren heel goed. Iederreen dier dat in de buurt komt, wordt aangevallen.de eieren komen na 3 maanden uit. Het vrouwtje houdt gedurende die periode het nest nat door erover te plassen of door op de eieren te kruipen als ze uit het water komt. De Mississippi-alligator verwijdert als het nodig is zelfs de rottende planten om de eieren op temperatuur te houden. In veel gevallen eet het vrouwtje heel weinig tijdens deze periode. Ze verbrandt het vet dat ze rond haar rug en staart heeft opgeslagen.
Als ze in het ei volgroeid zijn, breken de jongen hun eierschaal open met een eitand die op het puntje van de snuit zit. Ze maken ze maken knorrende geluidjes om er voor te zorgen dat moeder weet dat de eiren uit komen. De moeder reageert daarop door het nest bloot te leggen. Nog niet uitgekomen eieren kraakt ze tussen haar kaken open om de opgesloten jongen te bevrijden. Vervolgens neemt ze telkens een paar jongen voorzichtig in haar bek en draagt ze naar een rustig plekje in het water. . De moeder blijft goed op ze letten en beschermt ze, want de jongen zijn in dit gebied erg kwetsbaar. Ze vormen een makkelijke prooi voor otters, wasberen, reigers, varanen en waterslangen. Binnen een jaar zijn ze minstens twee keer zo groot. Gedurende een periode van 18 maanden blijven ze in hetzelfde deel van de rivier van hun moeder, voordat ze verder van huis gaan. Als ze drie jaar oud zijn, trekken ze weg om zich bij soortgenoten te voegen die een eigen territorium aan het verwerken zijn.
Echte krokodillen en alligators zijn geslachtsrijp als ze een bepaalde lengte hebben bereikt. Meestal zijn ze dan 5 tot 15 jaar oud, afhankelijk van de soort. Krokodillen worden heel oud. Sommige mensen beweren dat ze in het wild wel 100 jaar kunnen worden, maar dit is nooit bevestigd.